- Conservar el mosaico ecosistémico, conformado por lagunas costeras, playa, manglar, bosque seco, muy seco tropical y especies asociadas migratorias y residentes en arreglo de comunidades y patrones de paisaje del Caribe colombiano.
- Contribuir a la protección y mantenimiento de bienes y servicios ambientales en el Santuario.
- Proteger los atributos naturales y paisajísticos de valor cultural para las comunidades wayuu, afrodescendientes e indígenas de la Sierra Nevada de Santa Marta y sus alrededores, para contribuir a la preservación del patrimonio multiétnico y pluricultural de la nación.